本中心前身為「生醫材料工程跨領域研發中心」，成立於 2008 年，初期以 Medical Engineering Research Team、Multidisciplinary Technology 與 Metro Taipei 三大核心方向為發展主軸，並以 (M+T) × 3 = MT³ 作為中心英文識別概念，象徵跨領域研發能量的整合與延伸。

2015 年，在科技部的支持下，本中心進一步成立「科技部生醫材料表面工程產學技術聯盟」，旨在協助台灣生技醫材產業突破研發與法規驗證痛點的重要產學平台。透過產學合作機制，串聯學術研究與產業資源，進一步強化中心與產業界之間的連結。

隨著研究成果持續累積及發展方向逐步拓展，中心於 2023 年正式更名為「高值生醫材料研究與商品化中心」，並同步調整核心定位。

其中，Medical Engineering Research Team 更新為 Medical Engineering Team，Metro Taipei 則轉化為更具市場與商品化意涵的 Market Triumph，進一步強化從研發、跨域整合到市場實踐的發展方向。

配合中心定位轉型，英文識別亦由原先的 MT³ 更新為 MT3 PLUS，並重新設計 Logo，以嶄新的品牌形象呈現中心在生醫材料研發、跨領域技術整合及研究成果商品化上的持續深化與拓展。